项目管理

百迈客云平台以项目为中心,将项目进展、任务、数据、样品信息等统一放到项目中进行管理。

我的项目

创建项目

自建项目

我的项目页面,点击新建项目,可以开始创建自己的项目,如下图,项目名称必须输入,且建议只输入中文、数字、字母、中横线、下划线、点等字符,不要输入空格等非常特殊的字符,项目描述中可以填写一些关于该项目的详细说明,便于对该项目的内容有一个大致了解。

create-project

云服务项目

由科技服务部分析完成的项目,简称云服务项目,运营人员会通过后台管理员系统给您创建一个项目,并将结题报告推送到该项目中,之后您便可以在云上直接查看结题报告,并进行一系列个性化分析。

项目进展

  1. 项目进展自动同步给用户,用户可以在电脑端和微信端进行查询

  2. 用户可以催进展,运营收到后可以直接在系统上回复

  3. 用户可以就项目的不同阶段进行满意度评价

  4. 销售可以在微信端查看自己负责客户的项目进展

    project-progress

我的任务

当您通过分析平台或者工具提交一个任务之后,可以到我的任务中查看任务的详情,任务列表如下图:

task

任务筛选

点击任务列表左上角的任务名称,通过输入工具名或者任务提交时间对任务进行筛选,如下图:

task-search

任务详情

点击任务列表的第一列任务名称可以查看任务详细信息,包含任务基本信息、输入文件、参数设置、输出文件、日志信息、报错信息。

task-detail

我的数据

目录说明

我的数据
├── 个人数据
    ├── biomarker_project #项目数据目录,存放项目的分析结果文件等
    ├── biomarker_raw_data #存放推送数据时“是否推送固定目录”选择为“固定”时的数据
    ├── saved_data #该目录存放从各数据库中保存入的数据
    │   ├── gene_data #从功能基因数据库保存的数据
    │   ├── GEO #从GEO数据库保存的数据
    │   └── raw_sequencing_data #从高通量测序数据库保存的数据
    ├──Tools_files
    │   ├── Tool_input #工具和个性化使用时直接从本地上传的输入文件,按照年月进行命名
    │   └── Tool_output #工具的输出目录,以工具名和时间戳方式命名
    ├── ftp_upload #ftp上传后数据存放目录
    └── files #用户自己创建的目录或者上传的数据

├── 公共数据
    ├── BMK-Genome_data #百迈客云参考基因组数据库目录
    ├── BMKCloud_Getting_Started.pdf #百迈客云用户快速入门手册
    ├── BMK_sample_data 
    │   ├── APP #分析流程测试数据目录
    │   └── Tools #工具测试数据目录
    └── BMK_user_manuals #百迈客云用户使用手册目录

[warning] 注意:

以上目录(除去自己创建或者上传的文件)均由系统创建,因此不能删除和移动操作。

功能说明

graph LR; mydata(我的数据) --> quick-button(快捷按钮); mydata(我的数据) --> more(更多按钮); mydata(我的数据) --> right(右键功能); mydata(我的数据) --> count(选择计数); mydata(我的数据) --> pdir(快速切换目录); mydata(我的数据) --> search(文件检索); quick-button(快捷按钮) --> func(上传, 下载, 删除, 新建文件夹); more(更多按钮) --> func1(移动到, 复制到, 文本合并, 查看属性, 上传到SRA); right(右键功能) --> func2(打开, 下载, 重命名, 删除, 移动到, 复制到, 打开所在目录, 查看属性, 上传到SRA); right(右键功能) --> func3(右键工具: 格式转换, 文本处理, fasta工具, fastq工具);
快速切换目录

如下图所示,点击下拉列表中的目录,可以实现快速进入对应目录

pdir

文本合并

选中2个以上文本文件文件,可以进行此项操作,云平台上的文本文件包含以下所有类型,同时支持调整所选择的样品的顺序

graph TB; txt(txt) --> fasta(fasta); txt(txt) --> fastq(fastq); txt(txt) --> xls_txt(xls_txt); txt(txt) --> vcf(vcf); txt(txt) --> sam(sam); txt(txt) --> gff(gff); xls_txt(xls_txt) --> bed(bed); xls_txt(xls_txt) --> exp(exp); xls_txt(xls_txt) --> ed(ed); xls_txt(xls_txt) --> sv(sv); xls_txt(xls_txt) --> idxy(idxy); xls_txt(xls_txt) --> density(density);

merge-file

文件检索

  1. 支持分别在个人数据公共数据中进行检索,选中个人数据显示如下:

    mydata-search

  2. 支持文件类型的选择

  3. 支持文件大小的选择,可以设置文件大小的筛选范围,并支持修改文件大小单位(KB、MB、GB)
  4. 支持通过创建日期进行筛选
  5. 检索结果如下:

    search-result

文件上传

  1. 直接上传,由于网页文件传输受网络稳定性影响很大,因此当文件超过200M时,强烈建议使用FTP上传数据,否则很容易导致上传的文件不完整,而影响使用。

    upload

  2. FTP上传

    点击FTP上传之后,系统会给您平台绑定的邮箱发送一封邮件,邮件中包含了FTP账号和密码,已经使用说明,请您按照邮件中提示进行数据上传,遇到问题可以随时联系在线客服。

我的样品

sample

© 2018 biocloud.net版权所有 京ICP备16057269号            更新时间: 2018-10-11 17:42:43

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